公元2046年，在遥远的星球，一场电子人的起义即将爆发。博比前往地球，在与其孪生哥哥索尼见最后一面后被害。为了查清博比的死因，索尼决定前往另一个星球，一探究竟。在这个遥远的星球上，曾发生过一场大规模生化战争，大部分的居民死亡，幸存者面目全非。布瑞克曼带来了新的电子基因技术，向幸存者承诺十年的服务可以换取他们肉体的重新再生。如今已经十四年了，布瑞克曼并没有归还他们自由。博比本打算帮助大家逃脱布瑞克曼的控制，索尼决定帮助博比完成他的医院，索尼乔装成博比，成功帮助星球恢复了正常的生活秩序。

电影讲述了拥有音速奔跑能力的刺猬索尼克在地球上展开新生活的故事。索尼克和他的新朋友汤姆（詹姆斯·麦斯登 饰）联手保护地球，阻止邪恶的蛋头博士（金·凯瑞 饰）统治世界的计划。这部适合全家观看的电影还邀请了迪卡·桑普特参演，本·施瓦茨为索尼克配音。