小禽龙阿拉达生活在白垩纪晚期，他自小就生活在一个桃花园般的小岛上。由一群狐猴抚养长大大的阿拉达从来就没有见过自己的同类，与他的狐猴朋友一直无忧无虑的生活在一起。一场不期而至的流星雨将阿拉达所在的小岛击毁了，阿拉达和他的狐猴朋友一起逃难来到了大陆。这时，因为大气变热，水源供给越来越紧张，阿拉达他们遇上了一群正在迁徙寻找新的栖身之地的恐龙并加入了他们。于是，阿拉达和同伴们一起开始了这次异常艰难的迁徙之旅。

故事发生在6500万年前的白垩纪晚期。艾力达是一头禽龙，生活在一个世外桃源般的小岛上。它从未见过自己的同类，是一群狐猴将它养大。一场突至的流星雨毁灭了小岛，艾力达和几只狐猴朋友侥幸逃脱了这场劫难并来到大陆。它们加入了一群四处寻找安全的栖身之所的恐龙队伍。水源和食物的短缺、以及嗜血的食肉恐龙的不断侵袭时刻威胁着它们的生命。具有创新思想并对弱小同伴表示同情的艾力达与冷酷而固执的首领克龙和它忠诚的手下布鲁顿不可避免地发生冲突。在克龙的妹妹妮拉的支持下，艾力达向传统发起挑战并证明适应环境和相互团结才是最好的生存之

一名小男孩玩滑翔翼不幸失踪在索诺岛上。他的父母富商保罗与前妻阿曼达请求恐龙专家葛兰博士前往搭救。葛兰正拟进行一项史前动物研究，但苦于缺乏经费。在动之以利的情况下，“健忘”的葛兰博士鬼使神差地跟着他们上了飞机，一行人于是展开恐龙岛的搜索任务，尽管葛兰提出飞机不能直接降落在小岛上，然而不幸的是，由于机械故障，他们的飞机在安全降落前损毁，一头撞进了岛上的丛林，就在机上人员惊魂甫定之际，一群不知名的恐龙包围了飞机……可是他们万万没想到，最恐怖的事还在后头，因为恐龙已经聪明到会设置陷阱捕捉人类……

卢卡斯无意间在奶奶的老房子里得到一块水晶，意外来到了一座满是恐龙的小岛上，眼前的一切景象都令其不解，直到他遇到一个自称来自1950年代的怪异女孩凯特。原来两人被困在这个不知是何空间的地方，在此生活数年的凯特醉心研究恐龙，不料两人外出时却遭土著人追捕被抓。卢卡斯在同样被抓之人口中意外得知水晶里蕴含的巨大能量，在其指引下历经艰险找到水晶群，利用其能量最终与凯特重返现代，而凯特正是自己奶奶，凯特的研究也引起世界瞩目，获得了诺贝尔奖。影片立意新奇，时间旅行、史前生物无不抓人眼球，恐龙口下逃生颇有种侏罗纪世界的感觉

6500万年前，一颗小行星与地球擦肩而过，称霸这个世界的恐龙懵懵懂懂地逃过了灭顶之灾。之后又过了数百万年，恐龙的智力得到进化，它们学会种植、畜牧、建筑，并且拥有属于自己的语言和家庭。某座山脚下的平原地带，雷龙一家迎来三个性格各异的娃娃，最小的阿洛（雷蒙德·奥乔亚 Raymond Ochoa 配音）孱弱胆怯，与父亲的生离死别更在他的心中投下难以磨灭的阴影。一连串的事件过后，他与妈妈、两个哥哥相隔万里。阿洛将这一切都归罪于原始人类的小孩点点（杰克·布赖特 Jack Bright 配音）。而点点似乎不为所动，他

被外星人控制的恐龙王对地球发起了攻击，迷你特工队在强大的力量面前屡屡挫败，关键时刻，曾经与恐龙王有着深厚友谊的少年——杨能否重新唤起恐龙王的记忆，一起来对抗外星人。