《庚子风云》讲述的是公元1900年及中国历庚子年，八国联军攻占北京，并占领紫禁城，皇太后慈禧为避祸携光绪帝、大阿哥等人仓惶逃离皇宫，来到西安，最后又安全回宫的故事。慈禧太后临行前，由于政治立场不同的仇恨，将光绪皇帝深爱的妃子珍妃推入井中杀害。而当太后历尽千难万险来到古都西安时，却发现当地戏班的花魁白牡丹竟和珍妃长得一模一样！而这位本名斯琴的白牡丹却与在慈禧太后等人逃难至西安这条西行路上，给予了他们莫大帮助的一位从欧洲留洋五年回国的爱国青年陈然有着夙世姻缘，同时她也和陕西巡抚韩雨轩同样有着千丝万缕的关系。

清末，戊戌变法失败，谭嗣同、刘光弟等六君子血溅刑场，维新派人士的亲朋好友广受株连。以智勇双全和豪饮著称的侠士张三出现在长城烽火台上，他联结大刀王五等京城豪杰，救护死难六君子的遗属，不仅慈禧闻之丧胆，更使荣禄大为心惊。为残害张三，杨万禄父子将曾隐藏过刘光弟的于纪闻之女云娘抓来为诱饵。云娘逃跑，家丁追赶，路遇巾蝈女侠王丽媛女扮男装跟随至“天兴福酒楼”。王丽媛为主持公道，被杨家恶汉一掌险些打倒，此时藏在缸中的云娘被家丁发现，八卦掌门弟子挺身相救，混战一场，突然杨万侏拔枪欲射，一直在旁饮酒的张三突发奇招，将众人救