哥斯拉突然从北极的冰中出现！哥斯拉击沉核潜艇海洋号，更破坏北极的军事基地后开始南下。同样的时候，在太平洋制药宣传部，那公司为提高节目的收看率打算使用发俄岛上的魔神，樱井和古江的两名宣传人员便去了发俄岛。他们发现岛上出现的魔神就是金刚。于是把他弄晕带到日本，不久在运送金刚的船遭日本政府拦截，但那时金刚突然从麻醉中苏醒，在运输船上跑出来，游向日本，而且更在那须高原初次与哥斯拉对决。第1回合以哥斯拉的放射火焰取得胜利，金刚被打败吗？

警车上，落网的连续杀人犯槚津严（绪形拳 饰）神态轻松，并在后来的审讯中拒不交代杀死职员柴田与马场的经过……槚津严出身于信奉天主教的渔民家庭，由于宗教歧视，严家的小船被没收，年幼的严试图反抗却被父亲制止