神城麻郁从小在孤儿院长大，除了一张年代久远的照片外，他对自己的过去一无所知。一次偶然中，他在电视上看到了和自己手中照片上一模一样的房子，为了弄清楚自己的过去，他搬到了那幢房子里，并进入当地的高中就读。某天上学途中，麻郁遇见了正要被人非礼的女孩宫藤深衣奈，他意外的发现，自己和宫藤深衣奈有着相同颜色的眼眸。让麻郁没有想到的是，当晚，深衣奈竟然出现在了自己家的门口，并拿出了和麻郁一模一样的照片，声称自己饰麻郁的双胞胎妹妹。就这样，麻郁开始了和深衣奈的同居生活，随着时间的推移，两人之间的关系逐渐亲密起来。

4年前的"黄昏"事件告一段落之后，THE WORLD再次出现了神秘事件，而发生的一切，都与4年前的相似，受到玲奈的推动下，秀悟连说明书都没看就直接进入了THE WORLD。在对网络游戏发展惊讶之余，秀悟遇到了各种各样的角色。等到怜奈出现后，他们就开始了RPG游戏中最基本的工作--练级，而对限定角色产生兴趣的米蕾优，一直尾随他们来到了怪物平原。对于游戏经验不足的秀悟，很快就给打到重伤，幸好有怜奈的帮助，还是可以轻松地解决怪物。在玲奈的抱怨下，秀悟不得不翻开说明书。胸有成竹

鸨羽舞衣与弟弟巧海在摇摆的邮轮上等待到岸，他们的目的地是名为“风华学园”的高等学校。父母双亡的舞衣意外获得了风华学院的奖学金，决定与弟弟一起转到这所学校。大海航行之中，舞衣突然发现大海上漂流的一名少女。这名抱着大剑的少女名叫美袋命，舞衣将她救上船。随后，船上又出现一名名叫玖我夏树的神秘长发女子。夏树见到命之后立即要取对方性命，并召唤出机械兽参加战斗！舞衣被眼前发生的情景震惊，但此时，她的超能力也觉醒！原来舞衣也是拥有“HiME力量”的超能力者。战斗过后，舞衣与弟弟巧海继续向风华学园前进，却不知道，那里等待

一名戴面具的男子自昏迷中醒来，回忆一片空白，然而眼前所见到的，却是长着耳朵和尾巴的怪异女子。原来女子名叫艾露露（柚木凉香 配音）。艾露露告诉男子，她是“亚人类”，她和她同族的同伴们住在远离城市的深山之中，靠种植和农耕过着朴素的生活。族长将哈克奥罗（小山力也 配音）的名字赐予男子，从此，哈克奥罗便在这宁静的山村里过上了平静的生活。村子里住着一群善良快乐的人们，哈克奥罗运用自己的智慧帮助村民们开垦耕种，极快的提高了粮食的产量，同时在村民中也有了很高的威望。当村民们正为了这个丰收年而举族欢庆的时候，野心勃勃的