影片开始杨净如饰演的女记者谢琉璃，在偶然情况下邂逅身负一项绝密使命地下党，遭到特务围追堵截，谢琉璃拼尽全力帮其完成了任务，深入虎穴探听黑帮恶势力秘密。尽结尾才解密真实身份，表面看起来古灵精怪的女记者竟是地下党的英勇神枪手。代号“死神”的叶千川身处险境时，谢琉璃出现拯救其危难之中，双手握枪，尽显巾帼英豪的气势，也成为该片高潮迭起的重头戏码。

经过上一集的腥风血雨之后，伯恩（马特·达蒙 饰）和女朋友玛丽（弗兰卡·泼坦特 饰）隐居在印度偏僻的海边小镇，想忘记以前的生活。一天，神秘组织的杀手来到小镇，打破了伯恩二人世界的宁静，女友玛丽在逃亡途中被枪杀。为了查出真相，伯恩重新开始战斗，他发现以前工作的中情局开始重新寻找他，自己被卷入了一场刺杀活动中，被人诬陷破坏了中情局的一次情报交易，杀害特工。伯恩别无选择，他只能找到冒充自己的人，才能洗刷清白，为女友报仇。

影片故事发生在后斯诺登时代，中情局系统被黑客入侵， 多项特工计划可能泄露。与此同时，中情局还发现了伯恩和好搭档尼基·帕森斯的踪迹。年轻的网络专家海瑟·李自告奋勇追踪伯恩，而伯恩也在寻找着关于自己身世的惊天黑幕。中情局高官杜威是知晓一切幕后秘密的人，他、海瑟·李和伯恩之间的角力让影片充满悬念，不到最后一刻，就无法了解真正的结局。

继杰森·伯恩后，另一美国中情局特工艾伦.克劳斯Aaron Cross（杰瑞米·雷纳 Jeremy Renner 饰）亦将身陷险境。因为“杰森·伯恩事件”，令中情局的特工行动“绊脚石Treadstone”被公开，为了隐瞒其它特工行动，以拜亚ret. Colonel Eric Byer（爱德华·诺顿 Edward Norton 饰）为首的美国中情局，正计划铲除过去数十年来发展的特工行动，包括“结果Outcome”行动当中，体能和智能更“先进”的“5号”特工艾伦.克劳斯，展开横跨全球的逃杀。而艾伦.克劳斯剩下的

故事发生在上个世纪三十年代的上海，这个号称“东方巴黎”的中国东方大都市酝酿着重重危机，国民党与共产党十年内战的硝烟未散，日本军国主义的侵略魔爪却悄然而至。

杰森·伯恩事件引起连锁反应，踏脚石计划以及CIA用药物控制强化特工的行径通过报纸公之于众，令其幕后人物坐立不安。为了阻止满盘皆输的局面出现，CIA高层决定中止该计划，并将相关特工人员以及科学家从行动中抹杀。在此后的日子里，那些深藏在国家政治最底层、依靠蓝绿药丸执行各种绝密任务的特工相继殒命，而负责染脏双手的执行人——前美国空军上校艾瑞克·贝尔 ，正慢慢将屠刀伸向隐藏在位于阿拉斯加崇山峻岭、暴雪深山中的特工艾伦·克劳斯。突如其来的炮火袭击令艾伦意识到自己所处的危险境地，在之后的日子里，他不仅要在昔日同伴的追

杰森·伯恩在意大利被人从海上救起，他失去了记忆，除了臀部的瑞士银行帐号之外，他完全没有办法证明自己的身份。杰森从瑞士银行找到了大量的现金，六本护照，一把枪，同时他发现自己格斗、枪械、和语言等方面的能力，他开始追查自己的身份，并且把陌生女子玛丽也卷了进来。两人从瑞士到巴黎，一路上受到神秘杀手组织的追杀，危机重重。杰森能否化险为夷，找到自己的真实身份？他是否有勇气面对真相？

在“后斯诺登时代”，伯恩重出江湖，对抗大反派Asset。故事最开始将在希腊展开，这里是民主政治的诞生地，同时这个国家现在面临严重的经济危机，足以对欧洲经济圈造成巨大威胁，最后故事将在拉斯维加斯结束。