变种人天启诞生于人类文明的最开端，被人类当做神一般敬仰膜拜，然而，这样的他，却遭到了他最蔑视的人类的背叛，被埋葬于废墟石砾之下，一晃眼就是数千年过去。一场意外使得沉睡千年的天启从混沌中醒来，重返人间的他却发现曾经高贵的变种人，如今境遇十分糟糕。为了创造一个属于变种人的新世界，他找到了暴风女、灵蝶，天使，还有想要过平凡生活却依旧遭到人类驱逐的万磁王组成了天启四骑士。在察觉到天启的动向后，X教授带领着魔形女、野兽和凤凰等人，发誓要粉碎天启的阴谋。

该片是从《正义联盟：战争》开始的6年系列完结篇，“终结所有战争的一战”。讲述地球遇到大危机，大批DC超英对战达克赛德和他乌泱乌泱的队伍。“英雄变成反派，敌人变成盟友”，各个团队，各种爱恨情仇。

明末清初，乱世纷争。天启帝的太子朱慈燃从襁褓中便流落民间。天启7年，天启帝暴毙。同年，其弟信王朱由检继位，改年号崇祯，自崇祯元年起明王朝烽烟四起，闯王李自成，后金努尔哈赤纷纷起兵与明王朝分庭抗礼，崇祯帝一败涂地。流离失所的皇长子朱慈燃成为各政派系争夺的对象.为保太子平安，明朝忠臣冷延泉在民间寻回太子，并将其安排在灵岩寺假意出家为僧，不曾想风声走漏，已归顺清王朝的杭州织造局掌印大太监刘明喜带着大批锦衣卫杀上了灵岩寺，此后汉阳城左家军，大顺李自成亦是蠢蠢欲动。

锦衣卫褚思镜隐藏身份前往辽东调查出现的怪病，当地千总派鞑官伯颜随行。两人深入宁海堡，发现病患虽是风寒症状，但身上却有鳞片化症状。褚思镜调查中发现行踪诡异的乌暮岛民，于是连同伯颜凫水潜入乌暮岛。

少年刘横顺，一心想做守护九河城的大英雄。却每次都好心办坏事在抓贼时闯祸，从而被九河城百姓厌恶。因纸偶作乱河灯会，与操控纸偶的神秘少女小白不打不相识。追查之下，牵扯出十年前的白亭山大火案。在调查过程中，同狗腿挖棺贼孙小臭、机械天才杜帅、异能少女小白组成边缘调查团，揭开了神秘黑暗组织魔古道不为人知的惊天计划——人体兵器实验！为了守护九河城，刘横顺挺身而出、勇敢战斗。

正义联盟集结地球上所有超级英雄一起对抗强大的反派达克赛德。

掌控日本国家未来的御前会议上，众要员商议着以猎杀SPEC持有者为目标的“SIMPLE PLAN”，神秘的法蒂玛第三预言亦被提及。数天后，暗中执行猎杀计划的政府成员突然于游艇上全员木乃伊化死亡。案件交由未详系的当麻纱绫（户田惠梨香 饰）和濑文焚流（加濑亮 饰）负责。调查途中两人接到志村美玲（福田沙纪 饰）的求救电话，赶赴救援时与濑文的前同僚兼前恋人青池里子（栗山千明 饰）不期而遇。当麻将美玲带回未详系，原本已经死去的阳太/一十一（神木隆之介 饰）竟从容现身于她们面前。竭力压制着蠢蠢欲动的左手，当麻无力的目睹

周文突然惊醒，发现自己身边围绕着莺莺燕燕，一个青楼女子扮相的素不相识的女人正在和他说话。周文自称不知道为什么会在这里，为什么身穿锦衣卫的衣服,正在他迷惑不解的时候，屋内突然发生了巨大的爆炸,周文再次醒来，发现自己在一个复古气息浓郁的二手商店里，货架上、展柜中各种二手中古衣物，琳琅满目。一个满脸胡茬的大叔质问他刚才有什么线索，并告诉周文时间不多了，让周文抓紧时间，周文还没来得及张口询问，就又一次被送到了春风阁。在一次又一次的“穿梭”过程中，周文明白了自己的任务——调查天启年间北京上空神秘爆炸的真相，而每一次

变种人天启诞生于人类文明的最开端，被人类当做神一般敬仰膜拜，然而，这样的他，却遭到了他最蔑视的人类的背叛，被埋葬于废墟石砾之下，一晃眼就是数千年过去。一场意外使得沉睡千年的天启从混沌中醒来，重返人间的他却发现曾经高贵的变种人，如今境遇十分糟糕。为了创造一个属于变种人的新世界，他找到了暴风女、灵蝶，天使，还有想要过平凡生活却依旧遭到人类驱逐的万磁王组成了天启四骑士。在察觉到天启的动向后，X教授带领着魔形女、野兽和凤凰等人，发誓要粉碎天启的阴谋。

为了治疗因核辐射产生病变的人群，赛亚公司派出特勤小队到废弃的实验室寻找疫苗，谁知疫苗成功的关键是要牺牲队里唯一的女队员。在大家的努力下，疫苗研制成功。但队长偷走了疫苗，于是，众人沿着队长留下的痕迹，追了下去。