成为斗战胜佛的孙悟空竟被怨灵蛊惑，唐三藏遭遇灭顶之灾！危急关头，孙悟空揪出怨灵源头，却发现她竟是与自己有三百年缘分的天人界女神——“幸运星”！为了找出“幸运星”黑化的原因，拯救唐三藏，孙悟空踏上了一场回到过去之旅，却最终流下了一滴眼泪。大圣之泪，为何而流，为谁而流？

孙悟空被压五指山下四百年时，碰巧被阿一所救。阿一的父母被龙太子所杀，她想让孙悟空带她上天宫告状。龙太子得知孙悟空逃出了五指山，准备报当年东海龙宫被毁之仇，利用孙悟空的好兄弟蛟魔王刺杀他。虽然孙悟空被如来封了法力，但蛟魔王依旧刺杀失败。却带回了阿一，为了救阿一，孙悟空打到龙宫。孙悟空与龙太子从海里打到南天门。孙悟空最终被阿一感化，回到五指山继续修行，等待有缘人。

《西行纪之暗影魔城》讲述了暗影魔城之主摩璎为控制唐三藏夺取永恒之火，使用魔城能满足一切欲望的能力引出唐三藏心魔。最终，唐三藏克服心魔，重新觉醒，他与徒弟们联手打败摩璎，瓦解了祸害一方的魔城，重新踏上了拯救天下苍生的旅途。

本片为《大话西游》的上半部。故事开始是观音菩萨要除掉孙悟空，因其伙同牛魔王欲杀害师父唐三藏，并偷走了月光宝盒。唐三藏慈悲为怀，愿自杀以换悟空重生。五百年后，孙悟空投胎为强盗头头至尊宝。不巧撞见预谋吃唐僧肉的妖怪姐妹--蜘蛛精春三十娘和白骨精白晶晶。原来，500年前孙悟空和白晶晶曾有一段恋情，因而白晶晶与至尊宝一见钟情。此时，菩提老祖将二人的妖怪身份告诉了至尊宝，并同强盗们一起与二妖展开周旋。白晶晶为了救至尊宝打伤了春三十娘，却中毒受伤。至尊宝为了白晶晶来找春三十娘，却遭晶晶误会。白晶晶绝望自杀。至尊宝用月

《西行纪之集结篇》讲述了唐三藏与师徒四人取得“创世之火—奇经”交予天宫的十六年后，为了心中正义，再次集结成“西行小队”，重新踏上“还经”之路的故事。