故事讲述的是第一次世界大战前的加州，主人公是一名聪明伶俐而多愁善感的农家青年，由于他一直得不到严厉父亲的关爱，心中甚是愤恨，故意想尽方法打击天真的双胞胎弟弟，同时还把母亲未死而沦落风尘的真相揭露出来，故事的最后，由于主人公的一系列行为，导致了家破人亡的悲剧，令人唏嘘。

卡勒姆·林奇在死刑即将执行之前清醒过来，发现他被索菲娅选中，来参加一个能让人类摆脱暴力冲动的计划。虚拟现实机器Animus能让用户体验祖先的记忆，被绑在机器上之后，卡勒姆·林奇意识到他是生活在西班牙宗教法庭时期一位刺客阿圭拉的后裔，他们寻找的是可以控制自由意志的伊甸园苹果。索菲娅在父亲艾伦施加的压力下不情愿地操纵着卡勒姆·林奇回到过去寻找伊甸园苹果在现代世界的下落，威胁着他身体和心理的健康。但在杀手同行穆萨暗示了卡勒姆·林奇，提醒他艾伦有可能动机不纯之后，卡勒姆·林奇开始重新考虑他的行为和动机，而人类自由