经历过圣石之种事件半年后的高町奈叶与菲特·泰斯特罗莎两人则以朋友方式重逢，但随后卷入了一场袭击奈叶的大战。敌人目的正是以非法手段夺取魔导师的魔力资质，从而引发了时空管理局的重视和调查。

无数的光芒闪耀着五颜六色，浮游在空中的无重力空间——“知识之箱”。那里有着众多的世界、众多的时间、众多的人。杜娅尔和多萝茜两人在那里与敌人战斗着。敌人，那是侵食世界的存在——病毒。被病毒污染的世界，非得消除掉不可。这就是她们的任务、她们的工作。在某个时刻，杜娅尔和多萝茜感知到了新的病毒的出现。在那里，有一位被病毒袭击的少女。将少女救出来的两人，静静地等待着她醒过来。少女是什么人——来自何方，去往何处。不久后，少女醒了过来。这位少女自称为“莉莫”，不断低语着一句话——。“不回到花田的话……”。

古色古香的京都，奇妙的恋爱之旅正在展开。春天，黑发少女踏上寻找伪电气白兰地的夜之旅，学长却被从天而降的锦鲤砸晕；夏天，少女在旧书市寻找心爱的童年绘本，学长则面临残酷的火锅地狱；秋天，身背红鲤鱼的少女化身不倒翁公主，与拼死出演顽固王的学长相遇在学园祭的舞台；冬天，手持梦幻感冒药的少女打倒感冒之神，与学长一起向京都的天空飞去……

青龙和白虎为争夺所爱以至反目成仇，太子乃青龙的儿子，白虎掳走太子，教他枪法及杀人伎俩，目的是要太子杀他的生父龙。太子十八岁生日那天，虎赠他一女子菁菁做礼物，从此菁便随太子杀人。太子在杀龙行动中偶遇梦中情人翠儿以致失手。虎禁止他再见翠儿，菁钟情于太子，处处为他向虎隐瞒。虎再派太子往杀龙，龙重伤之际，虎突对太子道出龙乃他亲生父亲，可惜为时已晚，龙已死，太子伤心欲绝，沦为职业杀手。

居住在天空与海洋辉映的城镇“藤泽”的梓川咲太，就读高中二年级。他与既是学姐又是恋人的樱岛麻衣所度过的令人雀跃的日常，随着初恋对象牧之原翔子的出现而改变。不知为何，存在着“中学生”和“大人”两个翔子。出于无奈开始和翔子住在一起的咲太，受到“大人翔子”的捉弄，和麻衣的关系也变得尴尬。此时，“中学生翔子”身患重病的事实被发现，咲太的伤痕开始隐隐作痛——。

封印的卡片是《魔卡少女樱》又名《百变小樱》或《库洛魔法使》《CardCaptor Sakura》的第2部剧场版，第1部没有名字，大家公认为《香港之旅》。《封印的卡片》紧接在TV版70集后，是整个故事的大结局（不过后面还有一部同时上映的剧场版3，但与整个故事无关）

世界各地发生多宗少女失踪个案，幕后策划是Madame M ，她专门诱拐并训练貌美少女，令她们成为防不胜防的床上杀手。一群女孩被软禁在荒岛上进行地狱式的特训，钻研各类型的战斗知识及暗杀技巧。活泼开朗的海遥坚强沉郁的Katt先后抵达荒岛，二人在艰苦的考验中互相扶持。海遥及Katt执行任务，海遥负责色诱目标，然后以折断脊椎来杀死对方。

退伍炊事兵王援朝守着小饭馆，迎接着落寞的中老年生活，谁知在缅甸果敢支教的女儿竟 卷入当地黑帮斗争，老厨子只能召唤年少时的三位战友一同重操旧业:四个各怀神通的老 头在缅甸地头蛇少女的帮助下，共赴营救女儿，重温英雄梦想的战斗征程，然而摇摆不定 的少女所引发的谜团般的死亡阴影也逐渐逼近......

退休公安胡伯在离岛上过活，孙女阿初是问题少女，经常失踪。阿P为追回阿初欠她的债款，偶然遇见胡伯。胡伯苦缠她，要追踪阿初的下落。两个生活态度南辕北辙的人，就这样在荒谬的处境中相互学习。在短短两天内的追逐中，阿P看见的不是一个顽固苦闷的老头，而是身手敏捷、锄强扶弱的前任公安。阿P开始反省自己：十六岁的她，在爱情上无助，受软性毒品蚕食，面对父母失败的婚姻，以及自己浑噩的前途，尽是年青一代的无奈。

家里蹲孤僻少年诚被研究考古学的父亲带到了挖掘现场。诚在那里遇到了一个穿着比基尼、身材惹火的女神。女神自称是“古代战士多葛”，从一万年前的世界来到现代斩妖除魔。“多葛妹”东奔西跑，为了驱除复苏的妖魔鬼怪们全力战斗。在她的影响下，诚渐渐敞开了心扉……