赛菲罗斯的事件已经过去2年了，人类从巨大陨石的灾难之下逃脱。曾经繁荣的都市虽然满目疮痍，但人们已经开始投入重建家园的工作之中。而拯救世界的英雄克劳德，却过着与世隔绝的生活。\n　　但是，神秘的疾病“星痕症候群”在世界蔓延。蒂法•洛克哈特决定找寻克劳德。但当她找到克劳德之时，眼前这个人，只是一个为艾利斯之死郁郁寡欢的落魄男子。\n　　以继承赛菲罗斯的遗志而组成的白发三人组出现在人们眼前，文森特不得不再次挥动双枪，保护大家。而世界的英雄，克劳德，能否再次振作，守护这个世界呢？

故事讲述住在诺斯特拉达姆斯邻镇的努斯特拉达马斯留下了一个预言：“在 20 和 23 并列的年份，天上会降下两道光芒。一道是黑暗之光，另一道是小小的白光……不久，黑暗之光就会拥有强大的力量，扰乱和平，给世界带来巨大的混乱。”然后 2023 年夏天，两道光从宇宙接近。等待晚饭的新之助被白色的光击中了，身体充满不可思议的力量。“屁股……屁股热乎乎的……”一用力，玩具就会漂浮在空中！这是才能利新之助诞生的瞬间。另一方面，沐浴着黑光、成为黑暗护手的男人的名字是非理谷充。打工不顺利，推的偶像结婚，甚至被误认为是暴行犯

有一颗叫D60的行星，这颗星球是巨人幻兽战士们用来修炼的地方。失去记忆的雷古洛思奥特曼为了掌握“宇宙幻兽拳”，与好友迪亚斯一起在这颗星球修行。雷古洛思以前在交流拳法的时候认识了雷欧奥特曼。结果某天修炼的时候，雷古洛思听说了一件令人震惊的消息，雷欧的故乡L77星被马格玛星人毁灭了。在那之后没多久，马格玛星人的魔爪也伸向了行星D60。雷古洛思与修行宇宙幻兽拳的战士们并肩作战，最终驱逐了马格玛提督沃鲁冈所率领的侵略军团。虽然雷古洛思等人取得了胜利，但也付出了沉痛的代价。雷古洛思深刻意识到自己的实力还很弱小。

温氏横行，生灵涂炭。江湖仙门义士发动“射日之征”，合力讨伐温氏。“夷陵老祖”魏无羡虽在推翻温氏中立下了汗马功劳，却因修非常道且太过强大而遭人忌惮坑害，致万人唾骂，被情同手足的师弟带人端了老巢，身陨形灭……十三年后，魏无羡被人献舍，并再度与姑苏蓝氏蓝忘机、云梦江氏江澄等旧人相遇，前尘谜团未消，江湖疑云再起。而这一切恩怨情仇，都要从他们少年时说起……

塔露拉的愤怒和仇恨已经化为战火，带领切尔诺伯格核心城冲向龙门。唯有罗德岛这个中立组织，能够阻止整合运动的暴行，以及其背后的阴谋。同时，龙门近卫局的陈也扔下了自己的警官证，毅然决然前往切城核心城……

在“超高校级的绝望”带来的“人类史上最大最恶的绝望事件”之下，世界陷入了濒临崩坏的绝境。为了拯救这个充满绝望的世界，“未来机关”结成了。打倒了江之岛盾子的苗木诚等78期生，加入了未来机关。他们在此继续复兴世界的活动，但苗木却被问以庇护“绝望的残党”这一叛逆之罪。未来机关众人为了苗木的处分而聚集在一起，却遭到黑白熊的监禁，并被要求进行“最后的自相残杀”。手臂被戴上了奇妙的手环，过了一定时间就会被投以安眠药。不止如此，这其中还存在着“背叛者”，是为了杀掉未来机关而来的。“为了生存下去，非得找出背叛者并杀掉不可

主要讲述了TV动画中没有过多提到的小西马隆的少年王萨拉列基、古蕾塔等人和主人公涩谷有利发生的各种各样有趣的故事。

巡防视察卡罗利亚的魔王陛下一行，芙琳计划招待他们去一个能包治百病的秘境温泉旅馆里住宿。本该被包下的温泉里出现的人是？……