柯克船长（克里斯·派恩 饰）带领企业号继续踏上宇宙探索的旅程，他向老骨头（卡尔·厄本 饰）讲述了自己对于船长身份的忧虑，而在他与最好的朋友史波克（扎克瑞·昆图 饰）互诉衷肠前，他们又接到了一个紧急救援的任务。而神秘敌人剋劳（伊德瑞斯·艾尔巴 饰）开始攻击企业号，而幸存的企业号成员也分散至一个行星上求生。

在尼比鲁星球探查期间，企业号舰长柯克（克里斯·派恩 饰）为营救史波克（扎克瑞·昆图 饰）采取了胆大妄为的举动，几乎危及全舰队员的生命，他也为此付出代价。不久，柯克官复原职，而伦敦发生一起死亡超过四十人的恐怖袭击事件。该事件的始作俑者约翰·哈里森（本尼迪克特·康伯巴奇 饰）正来自联盟内部。此后他驾驶飞机袭击了高层会议，柯克最为敬重的派克将军不幸遇难。为了阻止哈里森的外逃阴谋，柯克重新率领企业号启程追击。危机重重的旅途，他和舰员、朋友之间的信任也受到巨大考验。

曾经，史蒂芬亦是怀揣着保家卫国的热血理想参军踏上了战场，然而，知道真正的身处于炮火之中时，史蒂芬才发现，战争，无论对于己方还是敌人，都是一场惨无人道的酷刑。史蒂夫幸运的成为了战场上的幸存者，返回了家乡，没想到这里一切早已物是人非，史蒂芬决定依靠自己的双手，重建家园。史蒂芬有两个孩子，在孩子们眼中，浴战火而重生的父亲显然就是英雄的典范，可是史蒂芬却想向孩子们揭开战争的残酷本质。两个孩子在一颗大树上建造了一间树屋作为秘密基地，没想到这间树屋却成为了另一场战争的导火索。

正义的反法西斯联军和纳粹法西斯德军在撒哈拉沙漠为了一口干枯的水井作战。想想：两只军队为了一口干枯的水井兵戈相见、殊死搏斗。为什么呢？联军知道水井里面没有水，但是不能放弃那道防线。不然，德军会越过防线威胁到更多的联军。可是，联军经过轮战斗后只剩下了9个人，并且弹药缺乏，只是以一所沙漠中破旧的古迹清真寺做掩护。再看看德军，他们有精良的装备、充分的弹药，人数上占绝对优势，900人左右。虽然，他们缺乏水。但是，这个巨大的悬殊，1：100的战斗对抗！不禁让人胆颤。经过激烈的战斗，联军胜利了！只剩下了两个人。

当年在努布拉岛营建侏罗纪公园时，约翰•哈蒙德曾把附近的索纳岛作为恐龙的制造工场。侏罗纪公园沦陷后，索纳岛上的恐龙在完全隔绝且缺少必要合成元素的情况下生存了4年时间。哈蒙德对此颇感好奇，他重新找到马科姆博士，邀请他前往小岛考察。4年前经历让马科姆心有余悸，他断然拒绝哈蒙德的提议，但当得知女友莎拉已前往小岛之时，只得跟随探险队整装出发。

地球并不只是人类的天下，其实有1500名外星人生活中我们当中，而星际移民局则处理和外星人相关的事情。纽约普通警察爱德华兹因缘际会之下加入了这一组织，成为MIB的一员，代号J，从此没有名字、没有身份，成为特警K的搭档。J应对的第一起事件就是虫族的入侵。亚基伦王子罗斯伯在地球被虫族杀害，而他随身携带的“银河系”——宇宙次原子能源的最好来源也失踪了，若虫族找到，将给亚基伦人带来毁灭性的打击。

艾莉·爱罗维自幼就对无线电通讯情有独钟。长大后，她成为一名天文学家，其项目内容为接收外太空信号。她希望能借此找到宇宙其他文明的存在。天才的理想得到的却是投资者的冷眼相看，幸好有神秘人帮助艾莉继续工作。一次偶然的机会，艾莉收到了来自织女星的频率信号，似乎证明了艾莉一直以来的工作是正确的。但这带来的不是她个人事业的成功，而是政治、社会、宗教、国家各个角度的矛盾

在本格拉丛林里，传说藏着三个分别用金、银、玉制作的神圣骷髅，将它们合为一体便可激发神奇的力量，从而统治世界。正因为如此，本格拉丛林吸引了来自世界各地的野心家，然而这里却藏着一个令他们闻风丧胆的人物，他就是骷髅奇侠。骷髅奇侠的真实身份是沃克尔家族，四百年前沃克尔的祖先落难于曼加勒岛，并受到土著捷嘉达族的救助。在此之后，捷嘉达族被海盗消灭，他们的神圣骷髅也流落本格拉丛林，从此世代受骷髅奇侠的守护。某天，纽约商人仙德尔·卓克斯派出手下闯入本格拉丛林，而新一代的骷髅奇侠将于他们展开新一轮的正邪大战。

胆小怕事但又生性喜欢冒险的鼹鼠，热情好客、充满浪漫情趣的河鼠，侠义十足、具有领袖风范的老獾，喜欢吹牛、臭显、追求时髦的蛤蟆、敦厚老实的水獭——他们生活在河岸或者大森林里，有乐同享，有难同当。虚荣的蛤蟆连连闯祸。为了教育他，动物们煞费苦心，对他百般说服教育。当蛤蟆的住宅被黄鼠狼霸占，他们联合起来，齐心协力，用智慧战胜了比他们数量多得多的黄鼠狼。蛤蟆大受感动，从此决心改正身上的毛病，变成一个好蛤蟆。

一次意外令 “急冻人”只能靠急救机器为生。他要将整个高谭市的温度保持在零度以下，否则他的妻子将不能醒来。蝙蝠侠是此计划的最大阻碍。罗宾成为蝙蝠侠的得力助手，两人合力化解了一次次阴谋。但“毒藤女”的出现给罗宾和蝙蝠侠彼此之间的关系带来了危机。